国内合作伙伴
成都大熊猫繁育研究基地
通过基金会的支持和资助下，成都大熊猫繁育研究基地在大熊猫迁地保护，繁殖育幼、疾病繁育、遗传管理等领域以及公众教育取得了众多标志性的成果。
成都动物园
基金会资助动物园开展众多关于濒危野生动物保护的科研项目，如大熊猫、金丝猴、豚鹿等。在公众教育方面，在基金会与成都动物园的共同努力下，成都动物园在2012年中国科协开展的全国科教教育基地认定中脱颖而出，中国科协命名为“全国科普教育基地”。
中科院
1949年，伴随着新中国的诞生，中国科学院成立。作为国家在科学技术方面的最高学术机构和全国自然科学与高新技术的综合研究与发展中心，建院以来，中国科学院时刻牢记使命，与科学共进，与祖国同行，以国家富强、人民幸福为已任，人才辈出，硕果累累，为我国科技进步、经济社会发展和国家安全做出了不可替代的重要贡献。
四川农业大学
基金会长期支持该校相关的大熊猫和小熊猫等珍稀濒危野生动物的科研项目，如“圈养大熊猫肠道病毒生态学调查及疾病病理库建立研究”、“大熊猫和小熊猫蛔虫的种群遗传与线粒体基因组研究”等。
浙江大学
基金会长期支持该校相关的大熊猫和小熊猫等珍稀濒危动物的科研项目，如“基于竹叶黄酮对生殖相关基因及其,MicroRNA表达调控的影响探索大熊猫生殖分子遗传机制”等。
四川大学
1997年，基金会和国家计委、国家科技部、四川省科技厅、成都市计委共同资助成都大熊猫繁育研究基地，联合四川大学在国内率先建立了濒危动物保护研究领域的开放实验室；2007年，该实验室成功获批“四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室-—省部共建国家重点实验室培育基地”。同时，基金会长期支持该校相关的大熊猫和小熊猫等珍稀濒危野生动物的科研项目，如“圈养林麝重要疾病流行规律及防控技术研究”、“藏酋猴微卫星分子标记的分离及其在圈养种群遗传管理中的应用”等。
